alternative a shell_exec

[InstinctHack]

Salut !
Dans le cadre du devellopement de mon framework, je possede un répertoire de ~50 fichier *.fonc.php et comme il fait parti du core, je doit tous les charger a chaque page! Et ca prend du temps :/
Donc facie je créer un systeme de cache qui ouvre chacun des fichiers et recopi leur contenu dans un seul, et ainsi je n'inclut qu'un seul fichier !
Mais désormais je trouve que le fichier contient trop de whitespace, donc j'essaye de supprimer le plus gros a cout de str_replace(), mais je decouvre

Code :

php -w <realpath_file>

Cela me permettrais de reduire pas mal mon fichier de cache.
sauf que shell_exec, je suis pas fou, c'est désactiver si une faille venait a etre decouverte dans mon application web.
Donc comment faire, a partir de php, envoyer un ordre d'exécution avec le safe_mode activer ?
la seule solution trouver est un touch(file_command) et un deamon qui execute son contenu quand la date de touch vient de changer, sauf qu'un deamon pour ca, je trouve ca lourd..
vous n'aurez pas une idée a me proposer ?